液相色譜儀的系統由儲液器、泵、進樣器、色譜柱、檢測器、記錄儀等幾部分組成。與經典的液相色譜相比，具有液相所用的固定相粒度小（５ｕｍ-１０ｕｍ）、傳質快、柱效高的優勢。近年來，在保健食品功效成分、營養強化劑、維生素類、蛋白質的分離測定等應用廣泛。世界上約有８０％的有機化合物可以用ＨＰＬＣ來分析測定。

液相色譜的分離過程 ＨＰＬＣ，借溶質在兩相間分配系數、親和力、吸附力或分子大小不同而引起的排阻作用的差別使不同溶質得以分離。

液相色譜儀操作步驟：

1)過濾流動相，根據需要選擇不同的濾膜。
2)對抽濾后的流動相進行超聲脫氣10-20分鐘。
3)打開HPLC工作站(包括計算機軟件和色譜儀)，連接好流動相管道，連接檢測系統。
4)進入HPLC控制界面主菜單，manual，進入手動菜單。
5)一段時間沒用，或者換了新的流動相，需要先沖洗泵和進樣閥。沖洗泵，直接在泵的出水口，用針頭抽取。沖洗進樣閥，需要在manual菜單下，先purge，再start，沖洗時速度不要超過10ml/min。
6)調節流量，初次使用新的流動相，可以先試一下壓力，流速越大，壓力越大，一般不要超過2000。injure，選用合適的流速，on，走基線，觀察基線的情況。
7)設計走樣方法。file，選取selectusersandmethods，可以選取現有的各種走樣方法。若需建立一個新的方法，newmethod。選取需要的配件，包括進樣閥，泵，檢測器等，根據需要而不同。選完后，protocol。一個完整的走樣方法需要包括：a.進樣前的穩流，一般2-5分鐘；b.基線歸零；c.進樣閥的loading-inject轉換；d.走樣時間，隨不同的樣品而不同。
8)進樣和進樣后操作。選定走樣方法，start。進樣，所有的樣品均需過濾。方法走完后，postrun，可記錄數據和做標記等。全部樣品走完后，再用上面的方法走一段基線，洗掉剩余物。
9)關機時，先關計算機，再關液相色譜。